Mesmo brava com o pai, Sydney ainda precisa trabalhar com ele, mas ela também não deixa por menos e envia uma carta à Cia revelando tudo o que ele fez no caso da bomba. Tudo isso, para evitar a execução de Irina, que aconteceria dali a 3 dias.
Jack, por sua vez, querendo recuperar a confiança da filha, se entrega e acaba preso. Numa manobra arriscada, Sydney seqüestra um senador e inventa que ela e Jack sabem de um segredo da SD-6, com o qual só eles podem lidar. A mentira cola e ela consegue a soltura de Jack e liberação da pena de morte de Irina.
Mas, como nem tudo pode estar bem, ela e Vaughn são colocados em quarentena, com suspeita de terem sido contaminados com um vírus novo. Os dois são liberados, mas Vaughn começa a apresentar os sintomas da doença misteriosa.
E Sloane começa a pagar seus pecados quando recebe telefonemas, tem a casa invadida e até mesmo vê Emily. Quando ele manda abrir o caixão da esposa, surpresa, o corpo, não está lá.